Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r16-202ENSMUST00000227283 5813 ntAPPRIS P2 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 n-R5s169-201ENSMUST00000083110 120 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Awat1-201ENSMUST00000096361 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Pcnx4-201ENSMUST00000044352 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm15123-201ENSMUST00000138988 339 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 1700028E10Rik-206ENSMUST00000202216 557 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm9985-201ENSMUST00000044101 510 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Olfr299-201ENSMUST00000057734 993 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Olfr653-201ENSMUST00000098174 1046 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Casr-203ENSMUST00000172826 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Alcam-207ENSMUST00000170035 1917 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Kars-ps1-201ENSMUST00000122077 1767 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 CT573019.1-201ENSMUST00000227762 1689 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm45174-201ENSMUST00000208884 3065 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Zbtb40Q6PCS8 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms