Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Myom1-201ENSMUST00000024847 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 D830032E09Rik-203ENSMUST00000189845 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Mas1-209ENSMUST00000167152 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 4930444M15Rik-201ENSMUST00000181972 1658 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Acsl6-207ENSMUST00000101213 2730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Cpb1-201ENSMUST00000011607 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Zfp882-201ENSMUST00000110002 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Mir501-201ENSMUST00000102296 109 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Igkv11-125-201ENSMUST00000103311 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Igkv3-4-201ENSMUST00000103401 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 D730003I15Rik-201ENSMUST00000139056 716 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Tpsab1-202ENSMUST00000153118 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm26070-201ENSMUST00000157500 137 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm5087-203ENSMUST00000161835 814 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm8374-201ENSMUST00000163826 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 4430402I18Rik-206ENSMUST00000164777 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm9568-201ENSMUST00000182514 1008 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm27350-201ENSMUST00000185109 98 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm28401-202ENSMUST00000190769 550 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm38086-201ENSMUST00000193543 434 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm44451-201ENSMUST00000203767 483 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm4574-201ENSMUST00000207804 542 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm18641-201ENSMUST00000211763 1246 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 AC140409.1-201ENSMUST00000213907 457 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 2310003N18Rik-201ENSMUST00000215655 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 AC153569.1-201ENSMUST00000215873 807 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm6989-201ENSMUST00000218409 654 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 AC147245.1-201ENSMUST00000223294 677 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Cst8-201ENSMUST00000028931 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Wdpcp-201ENSMUST00000020568 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Ivl-201ENSMUST00000053107 1922 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Olfr70-201ENSMUST00000055545 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Numb-207ENSMUST00000129335 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Jade1-206ENSMUST00000191952 3327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 AC132392.1-202ENSMUST00000216652 2681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm37266-201ENSMUST00000193802 2287 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 5730455P16Rik-201ENSMUST00000103225 4554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Pygb-201ENSMUST00000045441 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm15728-201ENSMUST00000140833 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Ugt1a6b-202ENSMUST00000113138 2303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Rtkn2-204ENSMUST00000118160 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Mrpl48-201ENSMUST00000064334 1865 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Mirg-204ENSMUST00000182185 3822 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Apex2-206ENSMUST00000112727 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Serpina3j-201ENSMUST00000109957 2155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Npnt-201ENSMUST00000042729 3601 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Fmnl1-203ENSMUST00000107027 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Parp11-203ENSMUST00000112193 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm3455-201ENSMUST00000204812 1954 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms