Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Ehbp1-201ENSMUST00000045167 4821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm8421-201ENSMUST00000119439 305 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm15624-202ENSMUST00000154953 713 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm25505-201ENSMUST00000157220 246 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm25342-201ENSMUST00000157459 122 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm29369-201ENSMUST00000190674 615 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm43212-201ENSMUST00000198208 394 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 A26c2-201ENSMUST00000207359 997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 1700011B04Rik-205ENSMUST00000220995 831 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm28906-201ENSMUST00000191371 1779 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Sdk2-201ENSMUST00000041627 11287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Odf2-206ENSMUST00000113759 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm39158-201ENSMUST00000210178 856 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Olfr1390-201ENSMUST00000062719 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Slco2b1-202ENSMUST00000107086 3993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Myrfl-201ENSMUST00000048229 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Usp19Q3UJD6 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm13486-201ENSMUST00000119910 282 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Usp19Q3UJD6 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms