Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Rpain-210ENSMUST00000167509 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Mir8095-201ENSMUST00000185103 129 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm8925-201ENSMUST00000197212 763 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm44643-201ENSMUST00000208542 674 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 AC154649.2-201ENSMUST00000228189 808 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 4930556J24Rik-201ENSMUST00000042344 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm30931-202ENSMUST00000211698 1320 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm17354-201ENSMUST00000170933 3039 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm15730-201ENSMUST00000121828 415 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm2800-201ENSMUST00000122988 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm16277-201ENSMUST00000143595 662 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Ets1-205ENSMUST00000184364 678 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm44231-201ENSMUST00000204106 4075 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm28818-201ENSMUST00000187553 2989 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Blm-201ENSMUST00000081314 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Rnf149Q3U2C5 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms