Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm13040-201ENSMUST00000094521 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Esf1-201ENSMUST00000046030 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Rpl36-ps2-201ENSMUST00000136893 311 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 4930580E04Rik-201ENSMUST00000197377 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 AC139569.1-201ENSMUST00000226080 614 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Unc80-206ENSMUST00000212557 9777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Skint7-204ENSMUST00000163281 1423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Tm4sf1-205ENSMUST00000196979 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Rfc1-201ENSMUST00000172732 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Dnase1-202ENSMUST00000120009 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm15835-201ENSMUST00000127697 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm29230-201ENSMUST00000189687 412 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 2900064K03Rik-201ENSMUST00000196567 3113 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Cps1-201ENSMUST00000027144 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 4930402H24Rik-201ENSMUST00000044766 6628 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Sorbs2-202ENSMUST00000067107 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms