Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 1700123O20Rik-203ENSMUST00000227269 893 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gprin3-201ENSMUST00000051065 8339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Cyp2c55-201ENSMUST00000025966 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm4524-201ENSMUST00000161614 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm12919-201ENSMUST00000119855 1594 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Pard3-220ENSMUST00000162456 3204 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 4930444A19Rik-201ENSMUST00000188243 2117 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm44823-201ENSMUST00000204775 1107 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm33037-201ENSMUST00000217927 642 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Trpm8-204ENSMUST00000171176 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gpx2-ps1-201ENSMUST00000160622 571 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Ighv13-2-202ENSMUST00000183954 302 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 AC159205.1-201ENSMUST00000225513 1099 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Cst11-201ENSMUST00000028934 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms