Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VhlP40338 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
VhlP40338 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VhlP40338 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
VhlP40338 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VhlP40338 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VhlP40338 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
VhlP40338 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
VhlP40338 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VhlP40338 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
VhlP40338 Slco1c1-201ENSMUST00000032362 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VhlP40338 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VhlP40338 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VhlP40338 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VhlP40338 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
VhlP40338 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
VhlP40338 Klrc2-205ENSMUST00000145984 2811 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm21051-201ENSMUST00000221757 1688 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm41-201ENSMUST00000116183 1023 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm12594-201ENSMUST00000132140 499 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm10680-201ENSMUST00000156612 702 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm27177-204ENSMUST00000184491 602 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm37800-201ENSMUST00000192129 664 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm4898-201ENSMUST00000218519 832 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Glycam1-201ENSMUST00000023134 628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Vmn1r9-203ENSMUST00000228714 4573 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm36981-201ENSMUST00000192340 4485 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm14214-201ENSMUST00000184654 678 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
VhlP40338 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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