Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Prokr1-203ENSMUST00000204682 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Zswim9-202ENSMUST00000119139 3986 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Cndp1-201ENSMUST00000070139 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Agtpbp1-202ENSMUST00000109830 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gad1os-201ENSMUST00000151851 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm3373-201ENSMUST00000169087 516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Mir7211-201ENSMUST00000184071 63 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Vps39-201ENSMUST00000028752 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Unc13d-203ENSMUST00000106451 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Plekhg1-202ENSMUST00000120274 7369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm26888-201ENSMUST00000181119 3683 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm24069-201ENSMUST00000104512 127 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Bglap2-201ENSMUST00000098956 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Slc5a9-203ENSMUST00000102721 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Fbln5-201ENSMUST00000021603 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm4613-201ENSMUST00000165488 276 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PtprkP35822 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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