Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Fam205a1-201ENSMUST00000107979 4146 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm24011-201ENSMUST00000157732 268 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm24738-201ENSMUST00000158856 123 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm29355-201ENSMUST00000188178 697 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm28953-201ENSMUST00000188336 697 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm20788-201ENSMUST00000190538 697 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm37395-201ENSMUST00000194721 697 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Reg1-201ENSMUST00000079926 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Unc13c-202ENSMUST00000184666 8796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Hps5-203ENSMUST00000107654 4422 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm26530-201ENSMUST00000180969 3941 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Dnase1l3-201ENSMUST00000026315 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr417-202ENSMUST00000217962 5662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Nae1-211ENSMUST00000162466 1735 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm44101-201ENSMUST00000203951 2221 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm9745-202ENSMUST00000187196 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
RxraP28700 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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