Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm30835-201ENSMUST00000198825 689 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm4872-201ENSMUST00000205210 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm44588-201ENSMUST00000208401 545 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 AC132384.1-201ENSMUST00000219908 1195 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm5668-201ENSMUST00000220897 436 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 AC154640.1-204ENSMUST00000227105 648 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Retnlb-201ENSMUST00000023328 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gstm5-201ENSMUST00000004134 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm34121-201ENSMUST00000206188 1490 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Cnpy1-205ENSMUST00000141601 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Fcrl5-202ENSMUST00000166297 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm14630-201ENSMUST00000118057 246 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm6798-201ENSMUST00000119961 360 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm11676-201ENSMUST00000120443 490 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Cul1-203ENSMUST00000143941 530 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm26040-201ENSMUST00000158147 161 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm23413-201ENSMUST00000175521 125 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 1700025H01Rik-201ENSMUST00000187479 547 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm28530-201ENSMUST00000190473 577 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm44725-201ENSMUST00000205307 391 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 4833412C05Rik-202ENSMUST00000208257 850 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm45338-205ENSMUST00000210795 728 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 AC241621.1-201ENSMUST00000224499 430 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 AC142114.1-201ENSMUST00000227724 328 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms