Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Chn1os1-201ENSMUST00000123613 636 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm11464-201ENSMUST00000146963 537 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm26184-201ENSMUST00000157686 131 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm20511-201ENSMUST00000174079 456 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Tnfaip8-213ENSMUST00000180305 369 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm26929-201ENSMUST00000182703 753 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Mir7060-201ENSMUST00000183486 137 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Scgb1b9-ps-201ENSMUST00000191567 266 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm19148-201ENSMUST00000197045 429 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Mef2c-219ENSMUST00000198217 1257 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Mef2c-225ENSMUST00000199210 1185 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Zfp474-202ENSMUST00000209270 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm5609-201ENSMUST00000210008 1267 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm4275-203ENSMUST00000210214 1298 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 AC159263.2-201ENSMUST00000221593 411 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 AC165254.1-203ENSMUST00000222925 574 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 AC130829.2-201ENSMUST00000222931 127 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 AL844586.1-201ENSMUST00000224297 1042 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 AC167019.4-201ENSMUST00000226494 1070 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Olfr877-201ENSMUST00000086063 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Olfr1283-201ENSMUST00000090328 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm29507-201ENSMUST00000187378 2088 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 4930442J19Rik-202ENSMUST00000157058 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Chrm2-202ENSMUST00000172278 5676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
P10404 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
P10404 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
P10404 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
P10404 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
P10404 Vmn1r21-203ENSMUST00000226191 1669 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.32
P10404 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
P10404 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Stag2-203ENSMUST00000115073 6171 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm16701-201ENSMUST00000181309 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 D7Ertd443e-203ENSMUST00000172947 2559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm45292-201ENSMUST00000211232 2207 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm9392-201ENSMUST00000119337 554 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm15343-201ENSMUST00000136382 640 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 9530026F06Rik-201ENSMUST00000141000 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms