Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm10482-202ENSMUST00000189825 2287 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Olfr524-202ENSMUST00000215815 5044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Mstn-202ENSMUST00000191197 2461 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Ttc16-201ENSMUST00000066478 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Il1bos-202ENSMUST00000156601 2425 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm9936-201ENSMUST00000201635 2925 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Hmgn2-202ENSMUST00000102552 676 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm13501-201ENSMUST00000118477 979 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm12178-201ENSMUST00000120545 330 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Rpl37rt-202ENSMUST00000124641 294 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm18560-201ENSMUST00000173463 1123 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm3252-202ENSMUST00000178748 450 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm18301-201ENSMUST00000185261 888 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm37432-201ENSMUST00000195294 341 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm37841-201ENSMUST00000195367 376 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Plut-203ENSMUST00000201192 569 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm9280-201ENSMUST00000223155 517 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Olfr878-201ENSMUST00000086061 1065 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Timp1-201ENSMUST00000009530 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 AC164437.4-204ENSMUST00000227169 4024 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Sp100-210ENSMUST00000147552 1597 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Elp3-201ENSMUST00000022609 2851 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Tmem268-202ENSMUST00000080336 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Zfp750-201ENSMUST00000092298 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Tyrp1-202ENSMUST00000102831 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 AC117656.3-203ENSMUST00000225007 1809 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Tmcc1-209ENSMUST00000173548 1622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Naalad2-204ENSMUST00000166825 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
Gm2056J3QQ02 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm38130-201ENSMUST00000194311 1761 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 AC122887.1-201ENSMUST00000219265 2722 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm14584-201ENSMUST00000118956 637 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm11440-201ENSMUST00000121509 527 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Ctcflos-202ENSMUST00000142207 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm2951-201ENSMUST00000169447 490 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
Gm2056J3QQ02 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms