Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Anapc15-ps-201ENSMUST00000099328 426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Smim18J3QNP2 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Mat2a-202ENSMUST00000205335 3387 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Mgam-206ENSMUST00000202779 3821 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm45297-201ENSMUST00000209893 3483 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 CT025548.2-201ENSMUST00000226227 1329 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Rasgrp1-203ENSMUST00000172901 1903 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Ssxb2-202ENSMUST00000103000 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Rhox4c-201ENSMUST00000115183 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm12038-201ENSMUST00000117322 207 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm12206-201ENSMUST00000119795 601 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm15646-201ENSMUST00000143317 766 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 4930562A09Rik-201ENSMUST00000153818 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm16541-201ENSMUST00000160992 614 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm17750-201ENSMUST00000182477 529 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm44778-201ENSMUST00000206447 668 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 2310001K20Rik-201ENSMUST00000206600 951 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm34474-201ENSMUST00000209645 356 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 AC163038.4-201ENSMUST00000224942 474 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Svs3b-201ENSMUST00000063132 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm17728-201ENSMUST00000076982 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Serpinb6b-202ENSMUST00000110293 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Xlr3b-201ENSMUST00000101486 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms