Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm42772-201ENSMUST00000199945 3041 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ceacam2-203ENSMUST00000066503 3140 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm24284-201ENSMUST00000104240 142 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm14891-201ENSMUST00000117378 596 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm11496-201ENSMUST00000128078 581 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm15787-207ENSMUST00000152014 885 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Lmo3-208ENSMUST00000203435 572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm44979-201ENSMUST00000206218 287 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 St7-203ENSMUST00000053148 2288 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 9430034N14Rik-201ENSMUST00000193532 3785 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm18957-201ENSMUST00000197623 1813 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Enox2-204ENSMUST00000114914 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Smarca2-204ENSMUST00000175791 946 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm4308-201ENSMUST00000179735 914 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm4301-201ENSMUST00000186197 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm4312-201ENSMUST00000190264 914 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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