Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Pdpk1Q9Z2A0 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 AC146596.1-201ENSMUST00000223507 223 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 CT009550.2-201ENSMUST00000228851 399 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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