Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm44862-201ENSMUST00000207981 1055 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm45698-201ENSMUST00000208537 1135 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm8512-201ENSMUST00000215367 471 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm40638-201ENSMUST00000216422 682 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm4178-201ENSMUST00000218307 649 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr108-202ENSMUST00000218675 1038 ntAPPRIS P2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AL645704.1-201ENSMUST00000221642 604 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Apoa2-201ENSMUST00000005824 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr108-201ENSMUST00000078207 1038 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Rpl27-ps3-201ENSMUST00000097682 475 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC079245.1-201ENSMUST00000215680 1454 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Fas-201ENSMUST00000025691 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Eif4b-201ENSMUST00000169681 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm3854-201ENSMUST00000207173 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Kng1-203ENSMUST00000089902 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Cnpy1-203ENSMUST00000120068 2284 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Ms4a4d-201ENSMUST00000025581 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps99-202ENSMUST00000223517 2338 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Ugt3a2-201ENSMUST00000072403 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Smg1-201ENSMUST00000032891 15557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Supt20-203ENSMUST00000197502 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm9750-201ENSMUST00000142025 2017 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Golgb1-202ENSMUST00000039855 10847 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr1115-203ENSMUST00000214119 2455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Cd59b-203ENSMUST00000111131 555 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm11765-201ENSMUST00000121173 1205 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 1700011I03Rik-204ENSMUST00000135806 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm24838-201ENSMUST00000158684 130 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm9531-202ENSMUST00000183511 775 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
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Rabgef1Q9JM13 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 9530078K11Rik-201ENSMUST00000208883 694 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm45238-201ENSMUST00000210204 517 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm32220-201ENSMUST00000218420 298 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC129975.2-201ENSMUST00000223705 775 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC125350.5-201ENSMUST00000226102 517 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC164879.1-201ENSMUST00000227904 1021 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Borcs8-201ENSMUST00000002418 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
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