Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Trav9d-2-201ENSMUST00000178824 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Trav9n-2-201ENSMUST00000180097 337 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Platr2-201ENSMUST00000180834 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm29016-201ENSMUST00000187523 1013 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm45388-202ENSMUST00000211101 815 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 AC137127.2-201ENSMUST00000215086 935 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 6330409D20Rik-201ENSMUST00000009695 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Ogdh-201ENSMUST00000003461 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Bbx-205ENSMUST00000114488 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Cyld-206ENSMUST00000209559 4476 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm44704-201ENSMUST00000208963 1990 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm20877-201ENSMUST00000100105 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm24335-201ENSMUST00000104211 132 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm13458-201ENSMUST00000118239 367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm5931-201ENSMUST00000121308 477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm15324-201ENSMUST00000139397 355 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm20917-201ENSMUST00000179922 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm21917-203ENSMUST00000180309 561 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm15013-202ENSMUST00000183728 801 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm42952-203ENSMUST00000197784 798 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 CT025618.1-201ENSMUST00000227409 1279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Higd1aQ9JLR9 Slc26a5-202ENSMUST00000115176 2768 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms