Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 4930447M23Rik-202ENSMUST00000141289 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Vmn1r54-202ENSMUST00000226921 3234 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm22439-201ENSMUST00000104048 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Cfap100-205ENSMUST00000135757 289 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 AC121793.1-201ENSMUST00000214211 633 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Olfr609-201ENSMUST00000055787 965 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gen1-201ENSMUST00000166117 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Eps15-204ENSMUST00000132165 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Plch1-210ENSMUST00000162269 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Lrmda-206ENSMUST00000162540 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Smarca2-210ENSMUST00000176475 983 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Ighv2-9-1-201ENSMUST00000180013 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Oosp1-203ENSMUST00000186557 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm6197-201ENSMUST00000192273 454 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Trip10Q8CJ53 Olfr672-201ENSMUST00000050599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms