Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gng7-204ENSMUST00000118233 3433 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Agtr1b-201ENSMUST00000068316 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Cd300ld-201ENSMUST00000045075 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 3632451O06Rik-202ENSMUST00000118129 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC138716.1-201ENSMUST00000226350 2959 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Kdm5a-201ENSMUST00000005108 10944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm3286-201ENSMUST00000171752 1316 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Vmn2r-ps53-201ENSMUST00000173045 2353 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Zmynd11-202ENSMUST00000110633 1857 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Apex2-204ENSMUST00000112721 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm9436-201ENSMUST00000120949 1855 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Mageb16-201ENSMUST00000052283 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Glb1l2-205ENSMUST00000162252 2209 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 AC154738.6-201ENSMUST00000227225 1352 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm12834-201ENSMUST00000121855 2829 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 2310040G07Rik-201ENSMUST00000101090 478 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm27509-201ENSMUST00000102400 79 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Cstl1-203ENSMUST00000109955 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm12980-201ENSMUST00000118912 336 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm5388-201ENSMUST00000120059 1117 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Mrgpra2b-202ENSMUST00000172559 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Ms4a10-203ENSMUST00000191343 862 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Klrb1c-203ENSMUST00000174404 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 4932438H23Rik-202ENSMUST00000114076 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 C5ar2-202ENSMUST00000171425 3381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Bbs9-201ENSMUST00000039798 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Znf48Q3US17 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Uspl1-204ENSMUST00000119685 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Olfr1212-202ENSMUST00000215781 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Xndc1-202ENSMUST00000106950 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Zhx3-201ENSMUST00000103111 9563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 AA414992-201ENSMUST00000221571 1576 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm19683-201ENSMUST00000209748 1781 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Olfr978-202ENSMUST00000217600 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Znf48Q3US17 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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