Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Ppfibp2-201ENSMUST00000040056 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm43766-201ENSMUST00000200590 5417 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Apbb2-204ENSMUST00000159786 6333 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm29240-201ENSMUST00000187248 286 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 1700020D05Rik-201ENSMUST00000189704 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm9497-201ENSMUST00000199908 538 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm44954-201ENSMUST00000208513 227 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 AC166052.1-201ENSMUST00000217028 397 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Extl2-203ENSMUST00000106502 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Abi1-212ENSMUST00000153931 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Slirp-204ENSMUST00000161023 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Slc17a6-201ENSMUST00000032710 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Abcb11-204ENSMUST00000180142 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm37274-201ENSMUST00000192167 1682 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm11318-201ENSMUST00000118640 961 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Tvp23bos-201ENSMUST00000148598 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Insig2-208ENSMUST00000160968 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm3611-201ENSMUST00000173687 877 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
TceancQ3US16 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms