Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 Arf4-202ENSMUST00000112318 1367 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Scd1-201ENSMUST00000041331 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 Gm14251-201ENSMUST00000122133 279 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 Gm27972-201ENSMUST00000184720 137 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 AC129017.2-201ENSMUST00000226118 1284 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Tmem209-202ENSMUST00000102991 1718 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Gm3752-201ENSMUST00000164366 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Ttc39dQ0VF76 Etnppl-202ENSMUST00000163620 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Ttc39dQ0VF76 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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