Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Anks1b-209ENSMUST00000182083 416 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm43425-201ENSMUST00000201793 3291 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
RxraP28700 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm5524-201ENSMUST00000185409 2002 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Ncoa2-203ENSMUST00000081713 8171 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Mep1b-201ENSMUST00000082235 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Ikzf5-201ENSMUST00000046306 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm15049-201ENSMUST00000120474 463 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm15417-201ENSMUST00000126926 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm43013-201ENSMUST00000198216 247 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm31305-201ENSMUST00000198557 710 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Vmn1r196-201ENSMUST00000091735 906 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Olfr131-203ENSMUST00000215940 1614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RxraP28700 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm37474-201ENSMUST00000194812 1814 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr1357-204ENSMUST00000213877 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RxraP28700 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
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