Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Fhl1-205ENSMUST00000114773 2298 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Btbd10-202ENSMUST00000117577 2384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm11649-201ENSMUST00000118214 375 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm5839-201ENSMUST00000182835 1007 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm27435-201ENSMUST00000183588 88 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm38328-201ENSMUST00000195582 317 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm9289-201ENSMUST00000221269 606 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 AC164302.1-201ENSMUST00000227036 433 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Vmn1r16-201ENSMUST00000227168 912 ntAPPRIS P2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Defa35-201ENSMUST00000078121 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm4956-201ENSMUST00000082032 1148 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 n-R5s156-201ENSMUST00000083377 105 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Tmem265-201ENSMUST00000084563 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Polk-210ENSMUST00000222389 1404 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Npffr2-201ENSMUST00000048557 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Proz-201ENSMUST00000033822 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm43519-201ENSMUST00000197239 1872 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 A730017C20Rik-205ENSMUST00000165666 1911 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Elmod2-206ENSMUST00000177594 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm37968-201ENSMUST00000195131 3201 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Efl1-201ENSMUST00000039881 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 9930111J21Rik1-202ENSMUST00000097494 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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