Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 D3Ertd751e-203ENSMUST00000108065 3452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 4930408K08Rik-201ENSMUST00000195936 1436 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm11207-201ENSMUST00000117824 414 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm8778-201ENSMUST00000127246 1107 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b4-ps-201ENSMUST00000186705 340 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm37822-201ENSMUST00000192618 1109 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm37432-201ENSMUST00000195294 341 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm38405-201ENSMUST00000207760 1140 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Cd37-208ENSMUST00000210372 960 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 1700030E10Rik-201ENSMUST00000218164 721 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC158983.1-201ENSMUST00000225691 221 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Cutal-202ENSMUST00000047447 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr1402-201ENSMUST00000060912 963 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Fam136b-ps-201ENSMUST00000068987 412 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm22830-201ENSMUST00000083772 130 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC161117.1-201ENSMUST00000221366 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Rorc-202ENSMUST00000197040 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Golga1-201ENSMUST00000039165 4869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Nrg4-213ENSMUST00000164721 1927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC154227.2-201ENSMUST00000228677 2101 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Med12l-202ENSMUST00000040325 10159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 R3hdm1-208ENSMUST00000187900 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Clasp1-201ENSMUST00000049404 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
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Rabgef1Q9JM13 Gm25501-201ENSMUST00000104429 132 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm15571-201ENSMUST00000119887 637 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
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Rabgef1Q9JM13 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm14339-201ENSMUST00000146224 423 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm15585-201ENSMUST00000149696 670 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Pitpnm2os2-202ENSMUST00000162577 744 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm8868-201ENSMUST00000173591 577 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm25442-201ENSMUST00000177270 92 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
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