Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r39-201ENSMUST00000226217 2258 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r39-204ENSMUST00000227555 2297 ntAPPRIS P2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r39-205ENSMUST00000228008 2283 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Ttc41-201ENSMUST00000061458 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm26831-201ENSMUST00000181458 1380 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm43488-201ENSMUST00000198874 2504 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm26705-201ENSMUST00000180761 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 A230001M10Rik-202ENSMUST00000196720 1307 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Tdrd3-203ENSMUST00000169504 5280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Igkv8-21-201ENSMUST00000103387 382 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm3618-201ENSMUST00000112726 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Rhox4c-201ENSMUST00000115183 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm12593-201ENSMUST00000120981 743 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 2310040G07Rik-202ENSMUST00000145897 462 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm24298-201ENSMUST00000158299 60 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm21965-201ENSMUST00000177770 384 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm11109-201ENSMUST00000180289 384 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm27043-201ENSMUST00000182807 958 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Ing5-203ENSMUST00000190476 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm8388-201ENSMUST00000193000 756 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm17978-201ENSMUST00000195986 769 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm43837-201ENSMUST00000200306 668 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 AC155644.1-201ENSMUST00000218527 890 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 AC165157.2-201ENSMUST00000222265 367 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 AC134577.2-201ENSMUST00000228541 715 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gstm5-201ENSMUST00000004134 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Rps6-ps2-201ENSMUST00000079841 747 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Defa28-201ENSMUST00000098887 400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Thnsl1-203ENSMUST00000102952 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm34004-201ENSMUST00000215460 2837 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Rfx4-202ENSMUST00000060397 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm37980-201ENSMUST00000194420 1910 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Vmn2r87-201ENSMUST00000164227 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Maml2-203ENSMUST00000177755 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm14682-201ENSMUST00000117977 524 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm12170-201ENSMUST00000119281 300 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Tctex1d2-201ENSMUST00000014220 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm20945-201ENSMUST00000178122 1145 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm3002-202ENSMUST00000178256 444 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm2974-202ENSMUST00000180184 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm10522-201ENSMUST00000194503 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc83Q9D4V3 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.3 ms