Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gatad2b-204ENSMUST00000199607 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Atp13a4-208ENSMUST00000182627 4238 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.61□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Mphosph9-201ENSMUST00000031344 7747 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 F13a1-202ENSMUST00000164727 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Mageb8-ps-201ENSMUST00000117228 1033 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm5759-201ENSMUST00000119203 811 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm42932-201ENSMUST00000197280 744 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm35315-202ENSMUST00000210052 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Psd3-204ENSMUST00000093469 4351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm13545-201ENSMUST00000119044 482 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm18254-201ENSMUST00000185699 1204 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm21923-201ENSMUST00000188455 696 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 1700039M15Rik-201ENSMUST00000195377 1120 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm37585-201ENSMUST00000195440 280 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm44096-201ENSMUST00000203171 504 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm39090-201ENSMUST00000205284 972 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Olfr1322-201ENSMUST00000070304 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
Ccdc47Q9D024 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
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