Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Zfp286-201ENSMUST00000054654 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Dlc1-206ENSMUST00000163663 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm13352-201ENSMUST00000117515 262 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Ear14-202ENSMUST00000228064 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm29091-201ENSMUST00000187289 2159 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Cul2-201ENSMUST00000025073 3727 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Fbxw10-201ENSMUST00000036085 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Ccdc114-203ENSMUST00000210602 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Ccr6-201ENSMUST00000097418 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Wfdc8-203ENSMUST00000109339 3227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Ceacam20-201ENSMUST00000094753 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Ikbkap-201ENSMUST00000030140 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Olfr342-201ENSMUST00000074192 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm6921-201ENSMUST00000161478 435 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rnf17Q99MV7 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms