Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm37883-201ENSMUST00000194970 725 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm24826-202ENSMUST00000197298 216 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Pde1c-207ENSMUST00000168944 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Usp47Q8BY87 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Usp47Q8BY87 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Usp47Q8BY87 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Il12a-201ENSMUST00000029345 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Usp47Q8BY87 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Glmp-209ENSMUST00000177005 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Usp47Q8BY87 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 9630013K17Rik-201ENSMUST00000146915 1072 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Usp47Q8BY87 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Usp47Q8BY87 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Usp47Q8BY87 Ccdc14-201ENSMUST00000023532 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm15448-201ENSMUST00000094911 1557 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Olfr551-202ENSMUST00000213540 5440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Tcf4-207ENSMUST00000114985 8577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Depdc5-205ENSMUST00000120902 5195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Rtel1-205ENSMUST00000108815 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Tssc1-206ENSMUST00000221877 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Mcf2l-205ENSMUST00000110871 3401 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Gm2788-201ENSMUST00000129551 797 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp47Q8BY87 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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