Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 AC122486.1-201ENSMUST00000221562 196 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm24032-201ENSMUST00000083932 159 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Vmn2r8-201ENSMUST00000172140 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Olfr1360-202ENSMUST00000205788 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Pcnp-204ENSMUST00000122253 792 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm44163-201ENSMUST00000205140 475 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm31036-201ENSMUST00000212925 521 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Usp54Q8BL06 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm18248-201ENSMUST00000191164 1846 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 A730036I17Rik-201ENSMUST00000143346 3431 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Olfr1339-202ENSMUST00000217522 2559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Lepr-201ENSMUST00000037552 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Zfp667-201ENSMUST00000086327 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Polr3f-201ENSMUST00000028914 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm9285-201ENSMUST00000177691 697 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm37328-201ENSMUST00000193191 640 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Sfrp4-204ENSMUST00000222992 1062 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms