Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 n-R5s74-201ENSMUST00000082654 116 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr1425-201ENSMUST00000087828 939 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Dsg3-201ENSMUST00000070892 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Prokr2-203ENSMUST00000110157 4005 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Tspan7-201ENSMUST00000076354 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 A030012G06Rik-201ENSMUST00000192385 1880 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC093043.2-201ENSMUST00000228616 2017 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Smok4a-202ENSMUST00000144015 2317 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 4933402D24Rik-201ENSMUST00000027102 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Nuf2-201ENSMUST00000028000 2068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Tsnaxip1-201ENSMUST00000034365 2210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 4833420G17Rik-203ENSMUST00000224312 3406 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm42866-201ENSMUST00000195919 3304 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 D830005E20Rik-201ENSMUST00000217716 1844 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm1123-201ENSMUST00000076730 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Mindy4b-ps-202ENSMUST00000191233 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm10538-201ENSMUST00000189499 1877 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm43376-201ENSMUST00000198939 1887 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 4933408N05Rik-201ENSMUST00000139864 1584 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Tifab-201ENSMUST00000169652 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Ppp1r2-ps2-201ENSMUST00000117103 635 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm11760-201ENSMUST00000122355 796 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Defa2-201ENSMUST00000170275 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm8868-201ENSMUST00000173591 577 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm25196-201ENSMUST00000180171 110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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Znf48Q3US17 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC153562.1-201ENSMUST00000215390 394 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Cinp-205ENSMUST00000221182 774 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Ofcc1-202ENSMUST00000224813 1043 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AC100209.1-201ENSMUST00000225562 409 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 9430069I07Rik-202ENSMUST00000227772 572 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gm7936-201ENSMUST00000069529 375 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Muc20-202ENSMUST00000115116 3673 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Gpbp1-201ENSMUST00000047627 3694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Pdzd2-201ENSMUST00000075317 10756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Cd200r4-203ENSMUST00000176819 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Smok2a-201ENSMUST00000080647 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 Rab23-202ENSMUST00000115174 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Znf48Q3US17 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms