Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr1451-202ENSMUST00000207997 1698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm19028-201ENSMUST00000189614 1873 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Trim30b-204ENSMUST00000164410 3042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Syn3-201ENSMUST00000120638 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Defa-ps7-201ENSMUST00000117139 168 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm26179-201ENSMUST00000177723 132 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm38204-201ENSMUST00000194835 619 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Ccl7-201ENSMUST00000021011 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AC115735.5-201ENSMUST00000228386 397 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Lhx9-203ENSMUST00000093486 4551 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Hsf3-201ENSMUST00000059003 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Synpr-202ENSMUST00000112656 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Larp1b-201ENSMUST00000026862 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 H2al2a-201ENSMUST00000105001 542 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm6434-201ENSMUST00000163316 372 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm7651-201ENSMUST00000173398 901 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm5103-201ENSMUST00000192081 1086 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 Tbca-204ENSMUST00000220825 497 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AC124510.2-201ENSMUST00000221958 683 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Trim71Q1PSW8 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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