Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm14116-201ENSMUST00000117733 805 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ttc21bQ0HA38 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ttc21bQ0HA38 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ttc21bQ0HA38 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ttc21bQ0HA38 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ttc21bQ0HA38 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ttc21bQ0HA38 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Ttc21bQ0HA38 Gm14747-201ENSMUST00000149888 984 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc21bQ0HA38 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms