Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm12445-201ENSMUST00000117947 885 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm16418-201ENSMUST00000118577 171 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm14830-201ENSMUST00000121899 700 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Nabp1-206ENSMUST00000188051 680 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm33926-201ENSMUST00000208755 357 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 AC153845.1-201ENSMUST00000213596 428 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 RMST_1.1-214ENSMUST00000220389 633 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 AC154785.1-201ENSMUST00000223280 572 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Iba57-202ENSMUST00000069631 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Prh1-201ENSMUST00000074042 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
VhlP40338 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Cenpc1-201ENSMUST00000031170 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Tns4-201ENSMUST00000017751 4755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Fgf2-203ENSMUST00000108120 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm15606-202ENSMUST00000139851 711 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm26980-201ENSMUST00000183321 395 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
VhlP40338 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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