Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm25164-201ENSMUST00000158908 116 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm34342-201ENSMUST00000192139 335 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm43558-201ENSMUST00000200155 210 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm7789-201ENSMUST00000210473 701 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Atp5l-ps1-201ENSMUST00000097132 312 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Hsd3b2-202ENSMUST00000107022 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm18305-201ENSMUST00000216532 2128 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Muc5b-201ENSMUST00000165147 14964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm26807-201ENSMUST00000181132 4363 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm7129-201ENSMUST00000117402 997 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm24893-201ENSMUST00000122745 369 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm12484-201ENSMUST00000156311 581 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm26662-201ENSMUST00000181129 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm44356-201ENSMUST00000196731 111 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm5547-203ENSMUST00000200182 683 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
H2-M1F7CXU4 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms