Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 4930553J12Rik-201ENSMUST00000023648 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Olfr5-201ENSMUST00000086318 1044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Tmem68-201ENSMUST00000029891 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Ide-201ENSMUST00000131070 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Olfr1386-202ENSMUST00000204518 2553 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Wdr61-205ENSMUST00000130368 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm12223-201ENSMUST00000135468 528 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm11632-201ENSMUST00000145489 674 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 1700012I11Rik-201ENSMUST00000187233 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 C430002N11Rik-204ENSMUST00000190054 443 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Pisrt1-201ENSMUST00000195532 515 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Tmem147-206ENSMUST00000208169 537 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Wdr61-201ENSMUST00000051822 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Clec3a-201ENSMUST00000009018 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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Rnf4Q9QZS2 Dpcr1-201ENSMUST00000095467 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Olfr472-201ENSMUST00000209670 5290 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Impg2-204ENSMUST00000160116 3992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm43279-201ENSMUST00000202376 2512 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 A130050O07Rik-201ENSMUST00000191963 3023 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Rhox4d-201ENSMUST00000115175 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm14745-201ENSMUST00000118480 1096 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm24307-201ENSMUST00000178512 101 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Rnf4Q9QZS2 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
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