Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Fshr-201ENSMUST00000035701 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 4930546K05Rik-202ENSMUST00000216586 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Ube2v1-201ENSMUST00000060645 1586 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Clip4-201ENSMUST00000024854 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Tmem209-203ENSMUST00000115157 2273 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 2010109I03Rik-201ENSMUST00000077004 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC122887.1-201ENSMUST00000219265 2722 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Tnfrsf19-202ENSMUST00000111236 3958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 2310005A03Rik-201ENSMUST00000142569 1398 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Rfx3-204ENSMUST00000172907 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm14403-202ENSMUST00000108947 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm14336-201ENSMUST00000117491 475 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm8644-201ENSMUST00000118619 596 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm14648-201ENSMUST00000119328 483 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm12124-201ENSMUST00000120504 679 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm14425-201ENSMUST00000121240 606 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Rpl21-ps15-201ENSMUST00000121545 483 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm11454-201ENSMUST00000144092 714 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm17053-201ENSMUST00000163501 495 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Zfp738-204ENSMUST00000175678 609 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Rpap3-ps1-201ENSMUST00000190928 454 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm8010-201ENSMUST00000194128 873 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm35067-201ENSMUST00000194355 647 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Ldhc-204ENSMUST00000210585 1071 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm29154-206ENSMUST00000213410 1180 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Lilrb4a-215ENSMUST00000220182 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm32834-202ENSMUST00000222417 655 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 9530002B09Rik-201ENSMUST00000024032 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Bdh2-201ENSMUST00000029817 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr1462-201ENSMUST00000076832 924 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Rpl21-ps7-201ENSMUST00000077420 483 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Tppp2-201ENSMUST00000008957 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm43942-201ENSMUST00000204522 2859 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Trpm8-202ENSMUST00000113114 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Nlrc5-201ENSMUST00000053085 6945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm15283-201ENSMUST00000125308 1451 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm26569-201ENSMUST00000181968 1789 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC140280.1-201ENSMUST00000227826 1847 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Pogz-201ENSMUST00000042402 4775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms