Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Defb46-201ENSMUST00000095436 174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Ccdc71Q8VEG0 Eya3-203ENSMUST00000081726 5160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm3234-201ENSMUST00000222644 5061 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Cherp-201ENSMUST00000079510 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Rasgef1b-210ENSMUST00000209346 3028 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1254-202ENSMUST00000111523 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Klrc1-201ENSMUST00000032270 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r40-202ENSMUST00000226925 3011 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm37304-201ENSMUST00000193833 2886 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm3072-201ENSMUST00000167712 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm43800-201ENSMUST00000201868 2731 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 CT030185.2-201ENSMUST00000222614 1310 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Ighv1-18-201ENSMUST00000103504 306 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Slc35a5-202ENSMUST00000114600 679 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm14727-201ENSMUST00000118526 525 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm14721-201ENSMUST00000121381 525 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm27360-201ENSMUST00000183487 80 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm43926-201ENSMUST00000203978 430 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Olfr221-203ENSMUST00000214342 1062 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm34654-201ENSMUST00000217012 535 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Hamp2-201ENSMUST00000074671 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Myo3b-203ENSMUST00000112243 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Atr-201ENSMUST00000034980 8056 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Rbms3-212ENSMUST00000174868 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Nlrp3-201ENSMUST00000079476 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Ptk6-201ENSMUST00000016511 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Rttn-201ENSMUST00000023828 7268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Zfp52-201ENSMUST00000079242 2175 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Ergic2-208ENSMUST00000136008 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm12187-201ENSMUST00000119584 1375 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 AC159886.2-201ENSMUST00000214737 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm25093-201ENSMUST00000103993 132 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm11889-201ENSMUST00000118402 1079 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Rsl24d1-204ENSMUST00000169399 841 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm3585-201ENSMUST00000173438 875 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
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