Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Lbhd1-202ENSMUST00000187504 3164 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37548-201ENSMUST00000194519 3814 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9256-201ENSMUST00000198106 1420 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6823-201ENSMUST00000120791 1839 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22022-201ENSMUST00000104355 127 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12868-201ENSMUST00000143801 417 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 4930426I24Rik-201ENSMUST00000180709 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6340-201ENSMUST00000183857 119 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27595-201ENSMUST00000184579 112 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29015-201ENSMUST00000187147 207 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 AC134606.1-201ENSMUST00000216324 721 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 CT009556.3-201ENSMUST00000226173 513 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 AC129537.1-202ENSMUST00000226619 430 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5815-201ENSMUST00000050706 1185 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Nasp-203ENSMUST00000081182 1461 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Plscr2-201ENSMUST00000034932 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20731-201ENSMUST00000193462 2288 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 AC210924.1-201ENSMUST00000221183 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Vps29-202ENSMUST00000117868 720 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15351-203ENSMUST00000153095 406 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Zwint-204ENSMUST00000160337 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8164-201ENSMUST00000169120 1192 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm23164-201ENSMUST00000175084 111 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Mir6921-201ENSMUST00000183719 80 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18484-201ENSMUST00000204389 991 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18207-201ENSMUST00000205486 526 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45509-201ENSMUST00000209624 1229 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 AC135292.2-201ENSMUST00000227559 367 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Lrrtm2Q8BGA3 Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms