Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm22581-201ENSMUST00000083735 136 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Ppp2r3c-201ENSMUST00000021410 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm37552-201ENSMUST00000193939 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Musk-208ENSMUST00000179951 3376 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Rgs8-202ENSMUST00000111810 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm20730-201ENSMUST00000103301 359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm28991-201ENSMUST00000186584 543 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 1700011B04Rik-207ENSMUST00000221256 800 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 1700011B04Rik-208ENSMUST00000221261 628 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 1700011B04Rik-210ENSMUST00000222668 821 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Slc3a1-201ENSMUST00000024944 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Unc5c-204ENSMUST00000130636 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm26813-201ENSMUST00000180778 3587 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Rapgef6-210ENSMUST00000207429 5164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Olfr569-202ENSMUST00000217024 4741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Olfr6-201ENSMUST00000040983 6834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm5361-201ENSMUST00000211041 1498 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Olfr1509-202ENSMUST00000205900 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Mtrf1-201ENSMUST00000022600 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Ice1-201ENSMUST00000043493 7667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm11840-201ENSMUST00000156947 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm4202-201ENSMUST00000169025 733 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Med13l-202ENSMUST00000201010 7781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Stat2-201ENSMUST00000085708 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Glod4-206ENSMUST00000169701 4203 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Shq1Q7TMX5 Tacc2-202ENSMUST00000059145 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms