Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3286-201ENSMUST00000171752 1316 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Rab3gap1-207ENSMUST00000212506 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC163102.1-201ENSMUST00000220789 1818 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgap10-203ENSMUST00000210922 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Apod-202ENSMUST00000115230 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Iqcc-202ENSMUST00000121442 491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16235-201ENSMUST00000146132 342 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19412-201ENSMUST00000185388 436 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb1b11-201ENSMUST00000186031 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb1b18-201ENSMUST00000191255 402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20128-201ENSMUST00000196189 417 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Cox19-207ENSMUST00000198966 475 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Oaz3-206ENSMUST00000204548 787 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap7-1-201ENSMUST00000056118 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 D930048N14Rik-201ENSMUST00000064493 3426 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Prpf31-206ENSMUST00000179769 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp383-201ENSMUST00000186475 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Gtpbp6Q3U6U5 Asb14-203ENSMUST00000165929 1817 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28422-201ENSMUST00000186112 1500 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33954-202ENSMUST00000195188 1500 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Tex28-201ENSMUST00000078060 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31983-202ENSMUST00000210553 3155 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Gtpbp6Q3U6U5 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Apol7a-204ENSMUST00000176074 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Ammecr1l-201ENSMUST00000115808 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Mtmr6-203ENSMUST00000224366 1968 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Gtpbp6Q3U6U5 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Gtpbp6Q3U6U5 Sap18-206ENSMUST00000143600 521 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Gtpbp6Q3U6U5 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9531-202ENSMUST00000183511 775 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 1700028B04Rik-201ENSMUST00000186274 555 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42789-201ENSMUST00000202276 567 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 1600020E01Rik-208ENSMUST00000205028 329 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms