Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Sestd1-202ENSMUST00000102660 8990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm18632-201ENSMUST00000222597 2087 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm25273-201ENSMUST00000104295 115 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm14864-201ENSMUST00000116164 1087 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Rps12-ps9-201ENSMUST00000139165 399 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Mir1968-201ENSMUST00000157429 68 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm3513-201ENSMUST00000161319 637 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm7200-201ENSMUST00000188426 1163 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Cacnb2-216ENSMUST00000195841 503 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Oosp1-201ENSMUST00000048214 972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm3383-201ENSMUST00000096171 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Sytl2-203ENSMUST00000107211 3790 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm44186-201ENSMUST00000204118 2752 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Mas1-206ENSMUST00000162333 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 1700060C20Rik-201ENSMUST00000109506 605 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Rnf149Q3U2C5 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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Rnf149Q3U2C5 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Olfr109-201ENSMUST00000031086 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Gm9801-201ENSMUST00000054860 408 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Keg1-201ENSMUST00000025598 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Tmem100-201ENSMUST00000092788 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rnf149Q3U2C5 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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