Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

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Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Gm12727-201ENSMUST00000119885 359 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm13673-201ENSMUST00000122056 531 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Gm45294-201ENSMUST00000210685 2102 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Gm8767-201ENSMUST00000215786 1070 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 1700009N14Rik-201ENSMUST00000029955 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Cytl1-201ENSMUST00000073554 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 AC153862.1-201ENSMUST00000215700 3349 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 I830077J02Rik-201ENSMUST00000098758 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Champ1-202ENSMUST00000128557 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Uhrf1-203ENSMUST00000113038 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Csnk1g1-209ENSMUST00000205379 4001 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Trim2-201ENSMUST00000054990 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Gm26520-201ENSMUST00000180719 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Erc2-210ENSMUST00000211145 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Gm20627-202ENSMUST00000176275 564 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Zbtb38Q3LR78 Gm35025-202ENSMUST00000193114 455 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 AC126691.2-201ENSMUST00000226185 249 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Zbtb38Q3LR78 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms