Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Thrb-201ENSMUST00000022303 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Zfp445-201ENSMUST00000056467 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Cldn34b2-201ENSMUST00000076671 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Clec1a-202ENSMUST00000203162 5128 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 BB031773-201ENSMUST00000148892 3655 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Itsn1-208ENSMUST00000114002 14012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm45746-201ENSMUST00000212623 2447 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Baz2a-203ENSMUST00000217851 8385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm35801-201ENSMUST00000193927 479 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Olfr32-206ENSMUST00000215765 1241 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gsta4-201ENSMUST00000034903 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Olfr1386-201ENSMUST00000071905 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Olfr32-201ENSMUST00000099755 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Mpp7-201ENSMUST00000115869 4975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Fto-203ENSMUST00000128081 4707 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Rgr-201ENSMUST00000022338 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Setd5-202ENSMUST00000113155 6362 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm9672-201ENSMUST00000166437 425 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 1810041H14Rik-202ENSMUST00000187218 434 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Ttc21bQ0HA38 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Uqcrh-201ENSMUST00000050580 402 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Uqcrh-202ENSMUST00000078676 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gm43311-201ENSMUST00000200016 2377 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 6030443J06Rik-203ENSMUST00000181764 4299 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 1600015I10Rik-201ENSMUST00000031837 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Ephx2-202ENSMUST00000224698 1985 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Rbm12-201ENSMUST00000059647 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ttc21bQ0HA38 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms