Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm18593-201ENSMUST00000200754 1139 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm42883-201ENSMUST00000202594 222 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm18944-201ENSMUST00000207672 643 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AL837512.1-201ENSMUST00000223914 1073 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Psg18-201ENSMUST00000003597 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm28852-201ENSMUST00000186666 2160 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm28880-201ENSMUST00000190161 2160 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Vmn1r4-202ENSMUST00000176838 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Tank-202ENSMUST00000112494 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm12145-201ENSMUST00000142108 217 ntTSL 3 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Cav1-209ENSMUST00000150901 380 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm42565-201ENSMUST00000197839 572 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 AC151904.5-201ENSMUST00000218975 549 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Olfr420-201ENSMUST00000068403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm5841-201ENSMUST00000195307 2177 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Parp6-202ENSMUST00000050483 2631 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm15759-201ENSMUST00000161126 3723 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm27048-201ENSMUST00000182891 4627 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Fam90a1b-203ENSMUST00000113903 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm8232-201ENSMUST00000164277 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm43534-201ENSMUST00000197685 2853 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Gm37995-201ENSMUST00000194958 1714 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Siah1bQ06985 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Siah1bQ06985 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Siah1bQ06985 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Siah1bQ06985 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Siah1bQ06985 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Siah1bQ06985 Gm16284-201ENSMUST00000140995 400 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Siah1bQ06985 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Siah1bQ06985 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Siah1bQ06985 n-R5s93-201ENSMUST00000180091 119 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Siah1bQ06985 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Siah1bQ06985 Ighv1-30-201ENSMUST00000194082 349 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Siah1bQ06985 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms