Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Sp1-204ENSMUST00000165924 4081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm2694-201ENSMUST00000180700 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm14729-201ENSMUST00000118373 689 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm8439-201ENSMUST00000171482 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm7452-201ENSMUST00000200764 788 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Rgs7-201ENSMUST00000027812 1418 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Pnliprp1-201ENSMUST00000048644 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm16057-201ENSMUST00000120811 759 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 AC166902.2-201ENSMUST00000215193 837 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Dicer1-201ENSMUST00000041987 9851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm36401-201ENSMUST00000194255 2028 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Crnn-203ENSMUST00000195515 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Diaph1-203ENSMUST00000115629 5416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Add1-201ENSMUST00000001108 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 AC132474.1-201ENSMUST00000214407 3686 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Igkv3-5-201ENSMUST00000103400 382 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm5711-201ENSMUST00000197896 421 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Vmn2r-ps26-201ENSMUST00000202039 2111 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Gm2754-201ENSMUST00000223383 589 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 CT009713.5-201ENSMUST00000224508 909 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Olfr671-201ENSMUST00000078710 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Obox4-ps28-201ENSMUST00000175654 1362 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Ikbkg-202ENSMUST00000064407 4530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Top2aQ01320 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms