Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Kansl3-204ENSMUST00000185912 4527 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm43612-201ENSMUST00000196087 3207 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
PtprkP35822 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Npm1-204ENSMUST00000109354 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Dusp21-201ENSMUST00000026018 845 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 2900027M19Rik-201ENSMUST00000207411 4448 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Nudt7-205ENSMUST00000147605 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm44812-202ENSMUST00000208999 1285 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Cyfip2-201ENSMUST00000093165 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Olfr60-203ENSMUST00000211031 2650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Olfr60-204ENSMUST00000215023 2692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 St6galnac1-201ENSMUST00000009732 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm44165-201ENSMUST00000203093 1469 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gpr35-201ENSMUST00000027489 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 4933402C06Rik-203ENSMUST00000207559 1227 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Olfr1349-205ENSMUST00000213504 4935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprkP35822 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Cops2-202ENSMUST00000110462 1853 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
PtprkP35822 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms