Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Homer1Q9Z2Y3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Homer1Q9Z2Y3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms