Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I0

Letm1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm1Q9Z2I0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Letm1Q9Z2I0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Letm1Q9Z2I0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms