Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lgr5Q9Z1P4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lgr5Q9Z1P4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lgr5Q9Z1P4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms