Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nek4Q9Z1J2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nek4Q9Z1J2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms